外泌體western鑒定時通常會檢測哪些指標蛋白?
根據(jù)22篇外泌體相關文獻的統(tǒng)計,排在前4位的檢測指標為CD63(13/22)、Tsg101(8/22)、 CD9和CD81并列第三位(6/22);接著檢測較多的4個指標為Alix(4/22)、 HSP70(3/22)、 flotillin (3/22)和Syntenin (2/22);此外還有一些指標僅在1篇文獻中出現(xiàn)過,例如HSP90、LAMP2B、LMP1、ADAM10、nicastrin、AChE、AQP2、RPL5、a-1AT。
針對外泌體的定性檢測至少選擇兩個指標就能滿足文章發(fā)表需要了,比如檢測CD63和Tsg101。
外泌體western鑒定定性檢測中有沒有陽性對照?
從發(fā)表的文章來看,并沒有一篇文章結(jié)果中提到了陽性對照樣品,但是已經(jīng)被文獻報道的樣品可以作為后人Western blot檢測實驗的陽性對照,通過這樣陽性樣品的檢測來判斷實驗體系是否正常。羅列一下文獻中的陽性對照樣品:脂肪組織巨噬細胞外泌體、神經(jīng)干細胞外泌體、大鼠皮層神經(jīng)元外泌體、SCC-9和Cal-27細胞外泌體、MDA-MB-231外泌體、星型膠質(zhì)細胞外泌體、中性白細胞外泌體等。
外泌體western鑒定主要檢測指標為CD63、CD9、CD81、Tsg101、Alix、HSP70等,針對外泌體的定性檢測,至少選擇2-3個指標就能滿足文章發(fā)表就可以。大部分文獻中沒有檢測內(nèi)參,個別文章中使用了Actin、GAPDH和Tubulin作為內(nèi)參進行檢測,外泌體中的Actin、GAPDH和Tubulin的表達豐度相對于正常細胞樣品中的較低,可能會檢測不到任何條帶或者條帶微弱。
外泌體western鑒定操作步驟大致是:
用PBS重懸提取的外泌體,滴于孔徑2 nm的載樣銅網(wǎng)上,室溫靜置2 min,用濾紙從濾網(wǎng)側(cè)邊吸干液體,用3%磷鎢酸溶液在室溫下負染5 min,濾紙吸干負染液,室溫晾干,電鏡觀察拍照。外泌體在電鏡下具有非常明顯的膜邊界、呈30~100 nm大小不一的茶托或杯狀結(jié)構(gòu)(也會有200 nm以下、較難鑒別的其他形狀的外泌體),但電鏡對樣品的預處理和制備要求較高,樣品分離方法和樣品性質(zhì)可能影響電鏡結(jié)果的好壞;樣品的準備階段比較復雜,不適合對外泌體進行大量快速的測量;且因外泌體經(jīng)過了預處理和制備過程,無法準確測量。
掃描電鏡(scanning electron microscopy, SEM)或透射電鏡(transmission electron microscopy, TEM)等電子顯微鏡可用于外泌體鑒定。SEM的工作原理是用能量為1~30 KV間的電子束,以光柵狀掃描方式照射到被分析試樣的表面上,利用入射電子和試樣表面物質(zhì)相互作用所產(chǎn)生的二次電子和背散射電子成像,獲得試樣表面微觀組織結(jié)構(gòu)和形貌的高分辨率信息。由于超高真空技術(shù)的發(fā)展,場發(fā)射電子槍的應用得到普及,現(xiàn)代先進的SEM的分辨率已經(jīng)達到1 nm左右,足夠用來進行外泌體尺寸的測量。TEM是把經(jīng)加速和聚集的電子束投射到非常薄的樣品上,電子與樣品中的原子碰撞而改變方向,從而產(chǎn)生立體角散射。散射角的大小與樣品的密度、厚度相關,因此可以形成明暗不同的影像,影像放大、聚焦后在成像器件(如熒光屏、膠片、感光耦合組件)上顯示出來。
以上兩種方法是常用的外泌體的鑒定方法,是展開外泌體功能研究的前提。比如在腫瘤研究中,通過提取鑒定不同細胞系中的外泌體,進而通過PCR以及測序篩選分析RNA,探究外泌體在腫瘤進展或者耐藥中的發(fā)生機制。